Currículum. Lo que puedo ofrecer
La ciencia de la vida
Aunque no está directamente relacionado con el que ha sido hasta ahora mi campo de investigación, siempre me han interesado las aplicaciones biomédicas de la nanotecnología. Los métodos de simulación que he estado utilizando para estudiar nuevos materiales son similares a los que se usan para análisis de dinámicas moleculares de sistemas biológicos complejos y estoy segura de que puedo aplicar mi formación con éxito a ambos campos.
Ahora que he terminado el doctorado, estoy buscando encaminar mi carrera hacia el mundo biomédico donde estoy deseando aplicar las habilidades en programación y en resolución de problemas que he adquirido estos últimos años. Tengo una sólida formación en matemáticas y, durante mi doctorado, la programación paso a ser parte de mi rutina diaria. Estas herramientas son la base para la bioinformática y creo que mi falta de experiencia en los aspectos específicos de la biomedicina la puedo superar muy pronto con trabajo duro e ilusión.
Con este propósito estoy haciendo varios cursos sobre diferentes temas técnicos relacionados como la estadística que hay detrás de los ensayos clínicos, una introducción a la bioinformática centrada en genómica y una introducción a los algoritmos de aprendizaje automático. Con estos cursos estoy aprendiendo sobre las interesantes aplicaciones de la analítica de datos en el campo de la ciencia de la vida.
Educación
Sep 2010 - Abr 2016
Universidad Autónoma de Madrid
Madrid, España
Doctorado en Física de la Materia Condensada y Nanotecnología
Tesis titulada "Caracterización de grafeno realista a través de los últimos desarrollos metodológicos basados en primeros principios". Cum Laude. Mención internacional.
- Propiedades de materiales bidimensionales
- Teoría del Funcional de la Densidad (VASP, OpenMX, Fireball)
- Simulación de microscopía de efecto túnel
- Desarrollo del código de microscopía de efecto túnel
- Cálculos en clusters superordenadores
- Escritura científica
Sep 2009 - Jun 2010
Universidad Autónoma de Madrid
Madrid, España
Máster en Física de la Materia Condensada y Nanotecnología
Tesis de máster titulada "Estudio teórico de las propiedades electrónicas e imágenes STM de (S)-Proline sobre Cu(110)”
- Nuevos materiasles y sistemas de baja dimensionalidad
- Monocapas auto ensambladas de moléculas orgánicas
- Simulaciones de microscopía de efecto túnel
Beca para el inicio de estudios de posgrado
- Organismo financiador: Universidad Autónoma de Madrid
- La beca cubría todos los gastos de matriculación del máster
Publicación de la tesis de máster
Este trabajo fue seleccionado para ser publicado en la primera edición de "Masters de la Universidad Autónoma de Madrid"
Este trabajo fue seleccionado para ser publicado en la primera edición de "Masters de la Universidad Autónoma de Madrid"
Sep 2004 - Jun 2009
Universidad Autónoma de Madrid
Madrid, España
Licenciatura en Física
Beca de excelencia (2004-2005)
- Organismo financiador: Comunidad de Madrid
- Nombre del proyecto: Oscilaciones de neutrinos
- Supervisora: Belén Gavela Legazpi (Grupo de astropartículas del departamento de Física Teórica, UAM)
Beca para el inicio en la investigación para alumnos de último año (2008-2009)
- Organismo financiador: Ministerio español de investigación y ciencia
- Nombre del proyecto: estudio de sistemas hadrónicos de alta densidad, desde el punto de vista de los experimentos de heavy atoms and its relevance within the theory of the fundamental interaction
- Supervisor: Carlos Pena Ruano (Instituto de Física Teórica, UAM)
Experiencia previa
Sep 2014 - Sep 2016
Universidad Autónoma de Madrid
Profesor ayudante
El contrato de Ayudante Universidad LOU (020020060) es un contrato otorgado por la universidad de acuerdo a los méritos y el progreso del proyecto de investigación de la tesis para financiar los últimos años de doctorado. En el contrato se incluye una cuota de docencia.
Jul 2014 - Sep 2014
Ministerio de Ciencia e Innovación
Personal investigador en formación
Contrato predoctoral financiado por un proyecto de investigación
- Nombre del proyecto: Force for Future: Advanced Force Technology for Future Nanoelectronics and Nanomedicine (Programa Consolider)
- Código del proyecto: CSD2010-00024
- Duración del proyecto: 27/12/2010 - 26/12/2015
- Investigador principal (grupo 3): José María Gómez Rodríguez
- Coordinador: Ricardo García García
12 May - 20 Jun 2014
Proyecto COST
Investigador visitante en la Universidad de Aalto
(Helsinki, Finlandia)
(Helsinki, Finlandia)
Misión científica breve (STSM) dentro de un proyecto europeo COST para visitar al grupo del Profesor Hannes Jonsson para trabajar en problemas sobre el cálculo de barreras energéticas mediante el método de Nudged Elastic Band (NEB) en distintos sistemas
- Nombre del proyecto: Reducible oxide chemistry, structure and functions
- Código del proyecto: Acción COST CM1104
- Duración del proyecto: 19/04/2012 - 18/04/2016
- Investigador principal: Rubén Pérez Pérez
Ene 2014 - Jul 2014
Ministerio de Ciencia e Innovación
Personal investigador en formación
Contrato predoctoral financiado por un proyecto de investigación
- Nombre del proyecto: Muestreo cuantitativo de la carga eléctrica a escala atómica usando fuerzas y corrientes
- Código del proyecto: MAT2011-23627
- Duración del proyecto: 01/01/2012 - 31/12/2014
- Investigador principal: Rubén Pérez Pérez
Feb 2013 - Ene 2014
Comunidad de Madrid
Personal investigador en formación
Contrato predoctoral financiado por un proyecto de investigación
- Nombre del proyecto: Nanoobjetos: desde átomos hasta virus
- Código del proyecto: S2009-MAT-1467
- Duración del proyecto: 01/01/2010 - 31/12/2013
- Investigador principal: Rubén Pérez Pérez
- Coordinador: Julio Gómez Herrero
12 May - 20 Jun 2012
10 Oct - 10 Nov 2012
Universidad Autónoma de Madrid
Investigador visitante en el Laboratorio Nacional Lawrence Berkeley (LBNL)
(Berkeley, California, EEUU)
(Berkeley, California, EEUU)
Visita al grupo del Profesor Miquel Salmeron para trabajar en proyectos comunes sobre la caracterización de óxidos y SAMs con técnicas SPM
- Nombre del proyecto: Theoretical-experimental analysis of the microscopic mechanisms associated to the catalysis in oxide surfaces
- Nombre del proyecto: Proyectos de Cooperación Interuniversitaria UAM-Banco de Santander con EEEUU
- Duración del proyecto: 01/06/2011 - 31/12/2012
- Investigador principal: Rubén Pérez Pérez
Ene 2012 - Feb 2013
Ministerio de Ciencia e Innovación
Personal investigador en formación
Contrato predoctoral financiado por un proyecto de investigación
- Nombre del proyecto: Force for Future: Advanced Force Technology for Future Nanoelectronics and Nanomedicine (Consolider Program)
- Código del proyecto: CSD2010-00024
- Duración del proyecto: 27/12/2010 - 26/12/2015
- Investigador principal (grupo 5): Rubén Pérez Pérez
- Coordinador: Ricardo García García
Oct 2010 - Ene 2012
Ministerio de Ciencia e Innovación
Personal investigador en formación
Contrato predoctoral financiado por un proyecto de investigación
- Nombre del proyecto: Atomic Scale Friction - Molecules in Motion (AFRI)
- Código del proyecto: MAT2008-02939-E/MAT FANAS-EUROCORES
- Duración del proyecto: 01/02/2009 - 31/01/2012
- Investigador principal: Rubén Pérez Pérez
Cursos y certificados
Mar 2017
SAS e-Course
Estadística I: Introducción a ANOVA, regresión y regresión logística
(en curso)
- Introducción a la estadística
- t-Tests y análisis de varianza
- Regresión lineal
- Diagnóstico a partir de la regresión lineal
- Análisis de datos categóricos
Feb 2017
SAS e-Course
Programación en SAS 1
Certificado del curso (24 horas)
- Introducción a la programación en SAS
- Trabajar con programas SAS
- Acceso a los datos
- Producción de informes detallados
- Formateo de valores de la base de datos
- Lectura de bases de datos SAS
- Lectura de hojas de cálculo y de bases de datos de Oracle
- Lectura de ficheros raw de datos
- Manipulación de datos
- Combinando bases de datos SAS
- Creando informes resumen
12 Feb - 20 Mar 2017
Johns Hopkins University
Maryland, EEUU
Bioestadística matemática II
Calificación obtenida: 100%
- Evaluación de la hipótesis
- Análisis binomial para dos muestras
- Análisis de datos discretos
- Técnicas
- Programación en R
12 Feb - 20 Mar 2017
Johns Hopkins University
Maryland, USA
Bioestadística matemática I
Calificación obtenida: 100%
- Introducción, probabilidad, valores esperados y vectores de variables aleatorias
- Probabilidad condicional, regla de Bayes, funciones de verosimilitud, distribuciones y asíntotas
- Intervalos de confianza, bootstrapping y representaciones gráficas
- Proporciones binomiales y logaritmos
- Programación en R
15 Jan - 28 Feb 2017
Universidad de California (San Diego)
California, EEUU
Encontrando mensajes ocultos en el ADN (Bioinformática I)
Calificación obtenida: 98% (con honores)
- Búsqueda de patrones frecuentes dentro de una sola cadena de ADN
- Búsqueda de patrones aglomerados
- Algoritmos de búsqueda de motivos presentes en varias cadenas de ADN: fuerza bruta, cadena mediana, voraz, aleatorizado y de muestreo de Gibbs
- Programación en Python
20 Ago - 13 Nov 2016
Universidad Stanford
California, EEUU
Aprendizaje automático
Calificación obtenida: 99.2%
- Aprendizaje supervisado: regresiones lineal y logística, redes neuronales, máquina de vectores soporte (SVM)
- Aprendizaje no supervisado: algoritmo K-means, análisis de componentes principales (PCA), detección de anomalías
- Aplicaciones y temas especiales: sistemas de recomendación, aprendizaje automático a gran escala
- Consejos sobre cómo construir un sistema de aprendizaje automático: sesgo/varianza, regularización, decidiendo qué hace a continuación: evaluación de los algoritmos de aprendizaje, curvas de aprendizaje, análisis de errores, análisis de techo
- Programación en Octave/Matlab
26 Oct 2016
Universidad Autónoma de Madrid
Madrid, España
IV Jornadas de encuentro entre investigadores y profesionales de la computación: Big data en biomedicina
- Aprendizaje automático para el análisis biomédico
- Tecnología cognitiva aplicada a oncología
- Aplicaciones bioinformáticas y simulaciones de la evolución del cáncer con HPC
2 Oct - 31 Oct 2016
Universidad de California (San Diego)
California, EEUU
Donde la biología se une a la programación: bioinformática para principiantes
Calificación obtenida: 99.4%
- ¿En qué parte del genoma comienza la replicación de ADN?
- De implantación de patrones a motivos reguladores
- Búsqueda de motivos reguladores: algoritmo voraz, aleatorizado y de muestreo de Gibbs
- Programación en Python
Oct 2016
Codecademy
Python
Curso completo (13 houras)
- La sintaxis de Python
- Condicionales y estructuras de control
- Listas y diccionarios
- Funciones
- Bucles
- Clases
- Lectura y escritura de ficheros
18 Jun - 30 Jul 2016
Universidad de Ciudad del Cabo
Rondebosch, Ciudad del Cabo, Sudáfrica
Entendiendo la investigación clínica: detrás de las estadísticas
Calificación obtenida: 100%
- Definición de los tipos de estudios
- Descripción de los datos
- Comprensión intuitiva de análisis estadísticos
- Contraste de hipótesis e intervalos de confianza
- Elección apropiada de test
- Análisis de la precisión de los resultados
25 Abr - 30 May 2016
Universidad Johns Hopkins
Maryland, EEUU
HTML, CSS y Javascript para desarrolladores web
Calificación obtenida: 99.3%
- Introducción a HTML5
- Introducción a CSS3
- Introducción a Javascript
- Prácticas con casos reales
Abr 2016
Codecademy
SQL
Curso completo (3 horas)
- Manipulación
- Consultas
- Funciones agregadas
- Tablas múltiples
Jun 2008
Universidad de Cambridge
Cambridge, Reino Unido
Certificado de inglés avanzado (CAE)
Certificado obtenido en junio de 2008.
Desde entonces el inglés ha sido mi idioma principal de trabajo. Toda la bibliografía y escritura en ciencia es en inglés. He asistido a conferencias internacionales donde mis ponencias han sido en este idioma y también defendí la tesis en inglés.
Desde entonces el inglés ha sido mi idioma principal de trabajo. Toda la bibliografía y escritura en ciencia es en inglés. He asistido a conferencias internacionales donde mis ponencias han sido en este idioma y también defendí la tesis en inglés.
Programación
Cálculo numérico
Desarrollo web
Otras aptitudes relacionadas
- Cálculos en clusters (experiencia corriendo en superordenadores de PRACE y de la RES)
- Habilidades básicas de paralelización en MPI
- Perfil de códigos para análisis de rendimiento
Otras aptitudes
Programas de visualización gráfica
80
Jmol/VMD/Pymol
Visualización de estructuras moleculares
95
Gnuplot
Gráficas con calidad de publicación
80
Gimp
Editor de gráficos rasterizados
85
LaTeX
Escritura científica
Idiomas
Otras aptitudes
- Ofimática
- SO: usuario avanzado de Windows y Linux
- Búsqueda en bases de datos de bibliografía (PubMed, ISI WoK)
- Redes sociales (blogs, Facebook, Twitter, LinkedIn)
- Carne de conducir 2005